Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG3

FAM25A, Protein FAM25A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25AB3EWG3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM25AB3EWG3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM25AB3EWG3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM25AB3EWG3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM25AB3EWG3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM25AB3EWG3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM25AB3EWG3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM25AB3EWG3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM25AB3EWG3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM25AB3EWG3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM25AB3EWG3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM25AB3EWG3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM25AB3EWG3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM25AB3EWG3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM25AB3EWG3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM25AB3EWG3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM25AB3EWG3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM25AB3EWG3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM25AB3EWG3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM25AB3EWG3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM25AB3EWG3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM25AB3EWG3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms