Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSPB2A8KAH6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSPB2A8KAH6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPB2A8KAH6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPB2A8KAH6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPB2A8KAH6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPB2A8KAH6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPB2A8KAH6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPB2A8KAH6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSPB2A8KAH6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSPB2A8KAH6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSPB2A8KAH6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPB2A8KAH6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPB2A8KAH6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPB2A8KAH6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPB2A8KAH6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPB2A8KAH6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPB2A8KAH6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPB2A8KAH6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HSPB2A8KAH6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HSPB2A8KAH6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HSPB2A8KAH6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPB2A8KAH6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSPB2A8KAH6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSPB2A8KAH6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPB2A8KAH6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPB2A8KAH6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPB2A8KAH6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPB2A8KAH6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms