Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A6NL46 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A6NL46 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A6NL46 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A6NL46 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A6NL46 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A6NL46 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A6NL46 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A6NL46 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A6NL46 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A6NL46 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
A6NL46 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A6NL46 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NL46 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NL46 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NL46 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NL46 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NL46 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NL46 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NL46 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NL46 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NL46 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NL46 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NL46 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NL46 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NL46 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A6NL46 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A6NL46 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A6NL46 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A6NL46 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A6NL46 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A6NL46 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A6NL46 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A6NL46 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A6NL46 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A6NL46 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A6NL46 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
A6NL46 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A6NL46 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A6NL46 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A6NL46 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A6NL46 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A6NL46 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A6NL46 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A6NL46 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A6NL46 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A6NL46 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A6NL46 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A6NL46 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A6NL46 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A6NL46 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A6NL46 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A6NL46 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A6NL46 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A6NL46 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A6NL46 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A6NL46 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A6NL46 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A6NL46 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A6NL46 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A6NL46 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A6NL46 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A6NL46 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A6NL46 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A6NL46 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A6NL46 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A6NL46 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A6NL46 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A6NL46 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A6NL46 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A6NL46 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A6NL46 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A6NL46 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
A6NL46 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A6NL46 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A6NL46 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A6NL46 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A6NL46 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A6NL46 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A6NL46 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A6NL46 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A6NL46 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A6NL46 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A6NL46 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A6NL46 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A6NL46 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A6NL46 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A6NL46 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A6NL46 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A6NL46 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A6NL46 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A6NL46 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
A6NL46 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A6NL46 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A6NL46 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A6NL46 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A6NL46 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A6NL46 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A6NL46 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
A6NL46 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms