Protein–RNA interactions for Protein: A6NJ88

SAGE2P, Putative SAGE1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAGE2PA6NJ88 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAGE2PA6NJ88 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms