Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPIPB15A6NHN6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPIPB15A6NHN6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPIPB15A6NHN6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPIPB15A6NHN6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPIPB15A6NHN6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPIPB15A6NHN6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPIPB15A6NHN6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPIPB15A6NHN6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPIPB15A6NHN6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NPIPB15A6NHN6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPIPB15A6NHN6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPIPB15A6NHN6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPIPB15A6NHN6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPIPB15A6NHN6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPIPB15A6NHN6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPIPB15A6NHN6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPIPB15A6NHN6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPIPB15A6NHN6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPIPB15A6NHN6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPIPB15A6NHN6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPIPB15A6NHN6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPIPB15A6NHN6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPIPB15A6NHN6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPIPB15A6NHN6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPIPB15A6NHN6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPIPB15A6NHN6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPIPB15A6NHN6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NPIPB15A6NHN6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPIPB15A6NHN6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NPIPB15A6NHN6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPIPB15A6NHN6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPIPB15A6NHN6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPIPB15A6NHN6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPIPB15A6NHN6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPIPB15A6NHN6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPIPB15A6NHN6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPIPB15A6NHN6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NPIPB15A6NHN6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPIPB15A6NHN6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPIPB15A6NHN6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPIPB15A6NHN6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPIPB15A6NHN6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NPIPB15A6NHN6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPIPB15A6NHN6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPIPB15A6NHN6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NPIPB15A6NHN6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPIPB15A6NHN6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NPIPB15A6NHN6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPIPB15A6NHN6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPIPB15A6NHN6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPIPB15A6NHN6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPIPB15A6NHN6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPIPB15A6NHN6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPIPB15A6NHN6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPIPB15A6NHN6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPIPB15A6NHN6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPIPB15A6NHN6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPIPB15A6NHN6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPIPB15A6NHN6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPIPB15A6NHN6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPIPB15A6NHN6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPIPB15A6NHN6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPIPB15A6NHN6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NPIPB15A6NHN6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NPIPB15A6NHN6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NPIPB15A6NHN6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPIPB15A6NHN6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPIPB15A6NHN6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPIPB15A6NHN6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPIPB15A6NHN6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NPIPB15A6NHN6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NPIPB15A6NHN6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPIPB15A6NHN6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPIPB15A6NHN6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPIPB15A6NHN6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPIPB15A6NHN6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPIPB15A6NHN6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms