Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC182A6NF36 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC182A6NF36 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC182A6NF36 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC182A6NF36 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC182A6NF36 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC182A6NF36 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC182A6NF36 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC182A6NF36 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC182A6NF36 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC182A6NF36 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC182A6NF36 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC182A6NF36 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC182A6NF36 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC182A6NF36 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC182A6NF36 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC182A6NF36 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC182A6NF36 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC182A6NF36 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC182A6NF36 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC182A6NF36 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC182A6NF36 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC182A6NF36 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC182A6NF36 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC182A6NF36 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC182A6NF36 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC182A6NF36 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC182A6NF36 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC182A6NF36 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC182A6NF36 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC182A6NF36 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC182A6NF36 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC182A6NF36 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC182A6NF36 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC182A6NF36 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC182A6NF36 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC182A6NF36 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC182A6NF36 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC182A6NF36 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC182A6NF36 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC182A6NF36 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms