Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MAP1LC3B2A6NCE7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP1LC3B2A6NCE7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MAP1LC3B2A6NCE7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms