Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC66A2RUB6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC66A2RUB6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC66A2RUB6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC66A2RUB6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC66A2RUB6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC66A2RUB6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC66A2RUB6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC66A2RUB6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC66A2RUB6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC66A2RUB6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC66A2RUB6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC66A2RUB6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC66A2RUB6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC66A2RUB6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC66A2RUB6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC66A2RUB6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC66A2RUB6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC66A2RUB6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC66A2RUB6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC66A2RUB6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC66A2RUB6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC66A2RUB6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC66A2RUB6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC66A2RUB6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC66A2RUB6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC66A2RUB6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC66A2RUB6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC66A2RUB6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC66A2RUB6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC66A2RUB6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC66A2RUB6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC66A2RUB6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC66A2RUB6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC66A2RUB6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC66A2RUB6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC66A2RUB6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC66A2RUB6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC66A2RUB6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC66A2RUB6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC66A2RUB6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC66A2RUB6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC66A2RUB6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC66A2RUB6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC66A2RUB6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC66A2RUB6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC66A2RUB6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC66A2RUB6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC66A2RUB6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC66A2RUB6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC66A2RUB6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC66A2RUB6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC66A2RUB6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC66A2RUB6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC66A2RUB6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC66A2RUB6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms