Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBA6A0AVT1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBA6A0AVT1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBA6A0AVT1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
UBA6A0AVT1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBA6A0AVT1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBA6A0AVT1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBA6A0AVT1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBA6A0AVT1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBA6A0AVT1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBA6A0AVT1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
UBA6A0AVT1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBA6A0AVT1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBA6A0AVT1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBA6A0AVT1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBA6A0AVT1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBA6A0AVT1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBA6A0AVT1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBA6A0AVT1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBA6A0AVT1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBA6A0AVT1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
UBA6A0AVT1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBA6A0AVT1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBA6A0AVT1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBA6A0AVT1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBA6A0AVT1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBA6A0AVT1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBA6A0AVT1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBA6A0AVT1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBA6A0AVT1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBA6A0AVT1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBA6A0AVT1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBA6A0AVT1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBA6A0AVT1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBA6A0AVT1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UBA6A0AVT1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBA6A0AVT1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBA6A0AVT1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBA6A0AVT1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBA6A0AVT1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBA6A0AVT1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBA6A0AVT1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBA6A0AVT1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBA6A0AVT1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBA6A0AVT1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBA6A0AVT1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBA6A0AVT1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBA6A0AVT1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBA6A0AVT1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBA6A0AVT1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBA6A0AVT1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBA6A0AVT1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBA6A0AVT1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBA6A0AVT1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBA6A0AVT1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBA6A0AVT1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBA6A0AVT1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBA6A0AVT1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBA6A0AVT1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBA6A0AVT1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
UBA6A0AVT1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA6A0AVT1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA6A0AVT1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA6A0AVT1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA6A0AVT1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA6A0AVT1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA6A0AVT1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBA6A0AVT1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBA6A0AVT1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBA6A0AVT1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBA6A0AVT1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBA6A0AVT1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBA6A0AVT1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
UBA6A0AVT1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBA6A0AVT1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBA6A0AVT1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBA6A0AVT1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBA6A0AVT1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBA6A0AVT1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBA6A0AVT1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBA6A0AVT1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBA6A0AVT1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBA6A0AVT1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBA6A0AVT1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBA6A0AVT1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBA6A0AVT1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBA6A0AVT1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBA6A0AVT1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UBA6A0AVT1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBA6A0AVT1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UBA6A0AVT1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBA6A0AVT1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBA6A0AVT1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBA6A0AVT1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBA6A0AVT1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBA6A0AVT1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBA6A0AVT1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
UBA6A0AVT1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBA6A0AVT1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UBA6A0AVT1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms