Protein–RNA interactions for Protein: A0A576

TCRBV9S1A1T, T-cell receptor beta variable 3-1 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV9S1A1TA0A576 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCRBV9S1A1TA0A576 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCRBV9S1A1TA0A576 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCRBV9S1A1TA0A576 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCRBV9S1A1TA0A576 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCRBV9S1A1TA0A576 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCRBV9S1A1TA0A576 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCRBV9S1A1TA0A576 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCRBV9S1A1TA0A576 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCRBV9S1A1TA0A576 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCRBV9S1A1TA0A576 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCRBV9S1A1TA0A576 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCRBV9S1A1TA0A576 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCRBV9S1A1TA0A576 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TCRBV9S1A1TA0A576 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCRBV9S1A1TA0A576 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCRBV9S1A1TA0A576 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCRBV9S1A1TA0A576 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TCRBV9S1A1TA0A576 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCRBV9S1A1TA0A576 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCRBV9S1A1TA0A576 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCRBV9S1A1TA0A576 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
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TCRBV9S1A1TA0A576 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TCRBV9S1A1TA0A576 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCRBV9S1A1TA0A576 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCRBV9S1A1TA0A576 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCRBV9S1A1TA0A576 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCRBV9S1A1TA0A576 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
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