Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A0U1RRA0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A0A0U1RRA0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A0A0U1RRA0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A0A0U1RRA0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms