Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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