Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX35

IGHV3-64D, Immunoglobulin heavy variable 3-64D, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-64DA0A0J9YX35 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-64DA0A0J9YX35 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-64DA0A0J9YX35 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-64DA0A0J9YX35 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-64DA0A0J9YX35 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-64DA0A0J9YX35 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-64DA0A0J9YX35 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms