Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S9

IGKV1D-37, Immunoglobulin kappa variable 1-37 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1D-37A0A075B6S9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV1D-37A0A075B6S9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV1D-37A0A075B6S9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV1D-37A0A075B6S9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV1D-37A0A075B6S9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV1D-37A0A075B6S9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV1D-37A0A075B6S9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IGKV1D-37A0A075B6S9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGKV1D-37A0A075B6S9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGKV1D-37A0A075B6S9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms