Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

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Length 2,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 CACNA1S-202ENST00000367338 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 TACC2-228ENST00000515273 9245 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 THBS1-201ENST00000260356 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 OTOF-205ENST00000403946 6937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AC000099.1-202ENST00000413812 1912 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 CACNA1C-207ENST00000399597 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 CACNA1C-208ENST00000399601 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 CACNA1C-217ENST00000399641 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 CACNA1C-218ENST00000399644 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 CCDC144A-206ENST00000399273 8686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 LMO7-201ENST00000321797 5647 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 PIK3AP1-203ENST00000371110 3151 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 ZSCAN31-203ENST00000414429 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 OSTN-AS1-201ENST00000430375 515 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 ANKS1B-205ENST00000546568 1281 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AC006141.1-201ENST00000581917 2170 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AC015871.4-201ENST00000624650 2260 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 PAICS-202ENST00000399688 3297 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 NVL-211ENST00000469075 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 PINK1-AS-201ENST00000451424 4443 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 GPR156-201ENST00000315843 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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CHD7Q9P2D1 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 ABCA8-201ENST00000269080 5677 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 CACNA1C-210ENST00000399606 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 CACNA1C-212ENST00000399621 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 CACNA1C-213ENST00000399629 6562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 CACNA1C-215ENST00000399637 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 CACNA1C-216ENST00000399638 6595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 CACNA1C-221ENST00000402845 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 MARF1-205ENST00000548025 5891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 CLIP1-201ENST00000302528 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD7Q9P2D1 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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