RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.11■□□□□ 0.49
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FOXD1Q16676 465 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NISCHQ9Y2I1 1504 aa14.29□□□□□ -0.12
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POTEDQ86YR6 584 aa14.12□□□□□ -0.15
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADRA2BP18089 450 aa13.96□□□□□ -0.18
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPP6R1Q9UPN7 881 aa13.93□□□□□ -0.18
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MSH5O43196 834 aa13.73□□□□□ -0.21
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ABCC9O60706 1549 aa13.62□□□□□ -0.23
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DNAJC5BQ9UF47 199 aa13.24□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa12.95□□□□□ -0.34
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KCNA4P22459 653 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa12.69□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa12.66□□□□□ -0.38
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UNC13AQ9UPW8 1703 aa12.6□□□□□ -0.39
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DMRT2Q9Y5R5 561 aa12.58□□□□□ -0.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP12.55□□□□□ -0.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EHMT2Q96KQ7 1210 aa12.54□□□□□ -0.4
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa12.46□□□□□ -0.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NACADO15069 1562 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BICRAQ9NZM4 1560 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NPM3O75607 178 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa12.31□□□□□ -0.44
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CECR2Q9BXF3 1484 aa12.3□□□□□ -0.44
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DCAF8L2P0C7V8 631 aa12.19□□□□□ -0.46
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CSRNP3Q8WYN3 585 aa12.19□□□□□ -0.46
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa12.07□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DCAF8L1A6NGE4 600 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYO15BQ96JP2 1530 aa12.06□□□□□ -0.48
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCRIBQ14160 1630 aa11.96□□□□□ -0.49
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CUX2O14529 1486 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZBTB22O15209 634 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11.79□□□□□ -0.52
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ERCC6Q03468 1493 aa11.75□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM41Q8WV44 630 aa11.74□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa11.73□□□□□ -0.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNF39Q9H2S5 420 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FOXD4L1Q9NU39 408 aa11.68□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC4A2P04920 1241 aa11.66□□□□□ -0.54
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NESP48681 1621 aa11.58□□□□□ -0.56
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC24A1O60721 1099 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 APLP2Q06481 763 aa11.52□□□□□ -0.57
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMARCA2P51531 1590 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NCAPD3P42695 1498 aa11.47□□□□□ -0.57
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HMGXB3Q12766 1538 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATXN8OSP0DMR3 200 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa11.35□□□□□ -0.59
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMARCA4P51532 1647 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa11.29□□□□□ -0.6
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WDR62O43379 1518 aa11.27□□□□□ -0.6
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.24□□□□□ -0.61
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDS5BQ9NTI5 1447 aa11.23□□□□□ -0.61
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CAPN15O75808 1086 aa11.21□□□□□ -0.61
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OSCARQ8IYS5 282 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PEG3Q9GZU2 1588 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARHGEF11O15085 1522 aa11.15□□□□□ -0.62
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CADPSQ9ULU8 1353 aa11.08□□□□□ -0.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CEP164Q9UPV0 1460 aa11.08□□□□□ -0.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MROH2BQ7Z745 1585 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARAP1Q96P48 1450 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FANCD2Q9BXW9 1451 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CYB5RLQ6IPT4 315 aa11□□□□□ -0.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POTEHQ6S545 545 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHD1O14646 1710 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DSG3P32926 999 aa10.97□□□□□ -0.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FKBP8Q14318 412 aa10.96□□□□□ -0.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POLA2Q14181 598 aa10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms