Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 PAK3-212ENST00000519681 2638 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 HDAC9-212ENST00000432645 3099 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 NRG1-212ENST00000521670 1769 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 DCTN4-215ENST00000627368 1774 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MAPK10-329ENST00000641555 2656 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SHROOM4-203ENST00000460112 8919 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ARFIP1-201ENST00000353617 3111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AGBL2-203ENST00000525123 3577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 BDKRB2-203ENST00000554311 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LRRC37A6P-202ENST00000448648 5444 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MSH2-202ENST00000406134 3628 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 STK26-201ENST00000354719 3179 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 BCL6-201ENST00000232014 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RASGRP1-213ENST00000561180 2707 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SLC5A6-201ENST00000310574 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SLC5A1-201ENST00000266088 5061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 GPR156-201ENST00000315843 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AL121832.3-201ENST00000616512 3700 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 OTUD6B-206ENST00000617869 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 GTF2H3-214ENST00000618160 3252 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 TRPV2-201ENST00000338560 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CDK10-201ENST00000331006 3344 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RASGRP4-219ENST00000618320 3313 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SELP-206ENST00000458599 1945 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ANKRD26P1-201ENST00000566201 3921 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZFP30-204ENST00000514101 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MMP20-201ENST00000260228 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 FHL1-201ENST00000345434 2458 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 FRMD6-201ENST00000344768 2972 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ADAM30-201ENST00000369400 2963 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 EIF3F-208ENST00000533626 7540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 DCTN1-205ENST00000409567 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PPP2R2C-202ENST00000335585 4092 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC004877.1-201ENST00000608963 4093 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC113-202ENST00000443128 5110 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RPE-216ENST00000454822 2130 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 COL12A1-201ENST00000322507 11723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC106788.1-201ENST00000550753 2661 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZFYVE26-201ENST00000347230 9675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 TCF7L2-216ENST00000534894 3778 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 GLYATL2-201ENST00000287275 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF17-201ENST00000307658 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZSWIM5P3-201ENST00000511265 2743 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 STK32B-207ENST00000512636 3272 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 GDNF-AS1-205ENST00000637926 3819 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RPAP3-201ENST00000005386 4370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CDK19-201ENST00000323817 6067 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 TAGAP-203ENST00000367066 3887 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LMO3-215ENST00000537304 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CACNG4-201ENST00000262138 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 TPD52L3-202ENST00000344545 2296 ntAPPRIS P4 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 DCAF8L2-202ENST00000451261 2295 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SFI1-203ENST00000400288 4002 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RBFOX1-223ENST00000620507 4018 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 C1orf74-201ENST00000294811 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 BTBD11-202ENST00000357167 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 DACH2-206ENST00000508860 1775 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 C14orf159-228ENST00000523771 2976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MEIS2-202ENST00000338564 4829 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZFP64-204ENST00000371515 3040 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC008870.1-201ENST00000566996 3009 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ARNT-208ENST00000505755 2427 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 GLRA1-201ENST00000274576 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms