Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
R3HCC1Q9Y3T6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1Q9Y3T6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1Q9Y3T6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1Q9Y3T6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1Q9Y3T6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1Q9Y3T6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1Q9Y3T6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1Q9Y3T6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1Q9Y3T6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1Q9Y3T6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1Q9Y3T6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1Q9Y3T6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1Q9Y3T6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1Q9Y3T6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1Q9Y3T6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HCC1Q9Y3T6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HCC1Q9Y3T6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HCC1Q9Y3T6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms