Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX20Q9UHI6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms