Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VNN3Q9NY84 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms