Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.027e-9■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 EIF3M-213ENST00000533439 749 ntTSL 514.86□□□□□ -0.033e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.037e-9■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 NOP58-208ENST00000488403 871 ntTSL 214.84□□□□□ -0.033e-11■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.051e-10■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 IQGAP1-212ENST00000560418 559 ntTSL 514.71□□□□□ -0.053e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.053e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.062e-7■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 WAC-220ENST00000532233 543 ntTSL 414.64□□□□□ -0.079e-9■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 PI4KB-208ENST00000455060 934 ntTSL 214.58□□□□□ -0.083e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 SLC25A36-212ENST00000513887 578 ntTSL 314.53□□□□□ -0.083e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 NOP58-202ENST00000426814 655 ntTSL 214.42□□□□□ -0.13e-11■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 WAC-218ENST00000528491 507 ntTSL 414.38□□□□□ -0.119e-9■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 UGGT1-207ENST00000488439 928 ntTSL 514.38□□□□□ -0.113e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 STXBP2-214ENST00000599400 811 ntTSL 514.35□□□□□ -0.113e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.115e-7■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.123e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.133e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 ARIH2-223ENST00000484999 728 ntTSL 514.23□□□□□ -0.134e-8■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 CCNL2-212ENST00000480646 614 ntTSL 314.23□□□□□ -0.133e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.133e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 DCTN4-207ENST00000519313 647 ntTSL 514.18□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.153e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 PIGS-208ENST00000577594 481 ntTSL 214.09□□□□□ -0.153e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.161e-10■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.187e-9■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.193e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 SLC25A36-215ENST00000631654 620 ntTSL 513.82□□□□□ -0.23e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 CCNL2-218ENST00000496007 4452 ntTSL 213.79□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 CCNL2-208ENST00000469113 707 ntTSL 313.77□□□□□ -0.213e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.223e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 EIF3M-209ENST00000531186 565 ntTSL 213.67□□□□□ -0.223e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 GSR-203ENST00000523295 913 ntTSL 313.6□□□□□ -0.232e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.243e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.263e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 PI4KB-212ENST00000489889 880 ntTSL 213.36□□□□□ -0.273e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 CCNL2-214ENST00000482365 2620 ntTSL 213.3□□□□□ -0.283e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.293e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.38e-7■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 C12orf4-205ENST00000541014 1049 ntTSL 513.19□□□□□ -0.33e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.35e-7■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 LINC01089-205ENST00000536662 560 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.312e-8■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.333e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 TRIT1-205ENST00000462797 2000 ntTSL 512.99□□□□□ -0.333e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 TRIT1-201ENST00000316891 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.333e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 PNPT1-204ENST00000429805 583 ntTSL 312.95□□□□□ -0.343e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.342e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 UGGT1-205ENST00000438277 3113 ntTSL 1 (best)12.88□□□□□ -0.353e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 SMAD5-209ENST00000514777 588 ntTSL 312.82□□□□□ -0.363e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 IST1-221ENST00000544564 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.378e-7■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 IST1-219ENST00000541571 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.378e-7■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 ARIH2-213ENST00000466850 546 ntTSL 212.61□□□□□ -0.393e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 CCNL2-211ENST00000480479 2792 ntTSL 212.61□□□□□ -0.393e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 MXD1-204ENST00000435990 860 ntTSL 312.55□□□□□ -0.43e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.43e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 STXBP2-219ENST00000600702 770 ntTSL 212.53□□□□□ -0.43e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 PRCC-206ENST00000491853 833 ntTSL 312.44□□□□□ -0.423e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 PIGS-214ENST00000584080 584 ntTSL 412.38□□□□□ -0.433e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 ARIH2-215ENST00000470296 457 ntTSL 1 (best)12.38□□□□□ -0.433e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 MIER1-207ENST00000371018 3875 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.443e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 MIER1-203ENST00000357692 4978 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.443e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 DCUN1D1-203ENST00000466812 461 ntTSL 212.3□□□□□ -0.443e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.443e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 CCDC125-204ENST00000460090 2273 ntTSL 1 (best)12.27□□□□□ -0.443e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 IST1-223ENST00000545518 710 ntTSL 212.22□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 PIGS-201ENST00000268758 2397 ntTSL 212.2□□□□□ -0.463e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 NGLY1-214ENST00000493324 3058 ntTSL 212.19□□□□□ -0.463e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 TRIT1-212ENST00000492612 983 ntTSL 512.16□□□□□ -0.463e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 SLC25A36-208ENST00000507429 3537 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.483e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 RBM5-211ENST00000462025 573 ntTSL 412.05□□□□□ -0.483e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 IST1-205ENST00000439924 1841 ntTSL 512.03□□□□□ -0.481e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 EIF3M-205ENST00000525782 2236 ntTSL 212.01□□□□□ -0.493e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 PHF21A-202ENST00000418153 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.493e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 PKN2-203ENST00000370521 6121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.53e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 TRIT1-215ENST00000541099 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.523e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.523e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 SUPT5H-203ENST00000402194 3698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.533e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 SUPT5H-201ENST00000359191 3770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.543e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 C12orf4-206ENST00000542080 561 ntTSL 411.62□□□□□ -0.553e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 C12orf4-203ENST00000535030 561 ntTSL 211.62□□□□□ -0.553e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 RNF10-203ENST00000413266 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.553e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 ANAPC7-204ENST00000464697 734 ntTSL 311.58□□□□□ -0.563e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 RNF10-214ENST00000540046 635 ntTSL 311.57□□□□□ -0.563e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 DCTN4-210ENST00000521093 473 ntTSL 411.55□□□□□ -0.563e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.563e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 LINC01089-204ENST00000535643 1014 ntTSL 1 (best)11.5□□□□□ -0.572e-8■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 SUPT5H-204ENST00000432763 3710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.573e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 ANAPC7-201ENST00000450008 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 AL136115.2-201ENST00000602889 587 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 SEC24C-203ENST00000465076 4668 ntTSL 1 (best)11.42□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 NOP58-204ENST00000467734 638 ntTSL 511.41□□□□□ -0.583e-11■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 RPF2-203ENST00000441448 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 SUPT5H-215ENST00000599117 3902 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.593e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 IST1-201ENST00000329908 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.598e-7■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 TRIT1-213ENST00000495175 1156 ntTSL 1 (best)11.28□□□□□ -0.63e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 IST1-215ENST00000538850 1125 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.618e-7■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 NOP58-205ENST00000472050 582 ntTSL 311.19□□□□□ -0.623e-11■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 SEC24C-201ENST00000339365 4513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.623e-6■■■■□ 26.3
RBM22Q9NW64 IST1-206ENST00000456820 2031 ntTSL 511.15□□□□□ -0.621e-6■■■■□ 26.3
Retrieved 100 of 21,863 protein–RNA pairs in 190.9 ms