Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR77

PXMP2, Peroxisomal membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXMP2Q9NR77 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PXMP2Q9NR77 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PXMP2Q9NR77 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PXMP2Q9NR77 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PXMP2Q9NR77 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PXMP2Q9NR77 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PXMP2Q9NR77 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PXMP2Q9NR77 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PXMP2Q9NR77 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PXMP2Q9NR77 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PXMP2Q9NR77 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PXMP2Q9NR77 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PXMP2Q9NR77 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PXMP2Q9NR77 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PXMP2Q9NR77 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PXMP2Q9NR77 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PXMP2Q9NR77 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PXMP2Q9NR77 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PXMP2Q9NR77 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PXMP2Q9NR77 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PXMP2Q9NR77 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PXMP2Q9NR77 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms