Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNMB3Q9NPA1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB3Q9NPA1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms