Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms