Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP44Q9H0E7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP44Q9H0E7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms