Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H5

ARHGAP39, Rho GTPase-activating protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP39Q9C0H5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP39Q9C0H5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms