Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDFIP1Q9BT67 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms