Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PMCHL2Q9BQD1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms