Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYCBPQ99417 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms