Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMG1Q96Q15 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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