Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
YTHDC1Q96MU7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC1Q96MU7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms