Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP47Q96K76 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms