Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAD52-216ENST00000543912 1243 ntTSL 1 (best)13.54□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CCND1-204ENST00000539241 920 ntTSL 213.52□□□□□ -0.257e-8■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DCUN1D5-208ENST00000529294 727 ntTSL 313.52□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ARFGAP2-226ENST00000532478 940 ntTSL 513.51□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ARFGAP2-217ENST00000528444 730 ntTSL 513.51□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MECR-203ENST00000453185 623 ntTSL 313.5□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ARFGAP2-201ENST00000395449 1772 ntTSL 513.49□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SEH1L-204ENST00000587761 863 ntTSL 513.47□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TNFRSF10B-205ENST00000519910 546 ntTSL 413.46□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CMC2-210ENST00000565514 262 ntTSL 313.44□□□□□ -0.265e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 UBN1-206ENST00000587027 837 ntTSL 313.42□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MECR-216ENST00000489248 968 ntTSL 313.4□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAD52-206ENST00000463750 1510 ntTSL 213.39□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMBIM1-213ENST00000444183 526 ntTSL 513.39□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MECP2-211ENST00000496908 342 ntTSL 1 (best)13.39□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MECR-211ENST00000475861 770 ntTSL 513.38□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 CABLES1-210ENST00000585061 584 ntTSL 513.37□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BCL2L2-PABPN1-202ENST00000556100 655 ntTSL 313.36□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SH3BP2-205ENST00000502260 727 ntTSL 313.34□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.272e-8■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 ZNF19-209ENST00000566202 587 ntTSL 513.33□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.285e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MECR-205ENST00000463412 915 ntTSL 513.31□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 SNX12-205ENST00000490561 862 ntTSL 1 (best)13.23□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.295e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KCNMB3-204ENST00000392686 2055 ntTSL 1 (best)13.22□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CYFIP2-222ENST00000620254 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 METTL22-205ENST00000562151 520 ntTSL 513.18□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SEC22A-203ENST00000466950 565 ntTSL 513.16□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 OGFOD1-204ENST00000563733 734 ntTSL 213.16□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.314e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 QRICH2-203ENST00000524722 2253 ntTSL 1 (best)13.11□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NT5DC1-203ENST00000419791 667 ntTSL 313.1□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MMP25-AS1-207ENST00000573878 483 ntTSL 313.09□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NDUFC1-208ENST00000513022 564 ntTSL 413.07□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 HSF1-210ENST00000532338 3451 ntTSL 213.05□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FOXP4-AS1-201ENST00000414386 419 ntTSL 213.02□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAD52-207ENST00000468231 2499 ntTSL 213.01□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NR1H3-215ENST00000461778 726 ntTSL 513.01□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RGS3-207ENST00000374140 4591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PPHLN1-218ENST00000551723 415 ntTSL 513□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CARD19-207ENST00000490488 759 ntTSL 1 (best)12.99□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 54.9
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