Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CAVIN3Q969G5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CAVIN3Q969G5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms