Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF25Q93038 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF25Q93038 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms