Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D1Q8WV19 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFT2D1Q8WV19 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms