Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM1

ZNF680, Zinc finger protein 680, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF680Q8NEM1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF680Q8NEM1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF680Q8NEM1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms