Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC191Q8NCU4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC191Q8NCU4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC191Q8NCU4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC191Q8NCU4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC191Q8NCU4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC191Q8NCU4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC191Q8NCU4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC191Q8NCU4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC191Q8NCU4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC191Q8NCU4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms