Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRSAM1Q6UWE0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms