Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GKAP1Q5VSY0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GKAP1Q5VSY0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms