Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP188Q5SRE5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms