Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN2

KRTAP19-2, Keratin-associated protein 19-2, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-2Q3LHN2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-2Q3LHN2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-2Q3LHN2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-2Q3LHN2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-2Q3LHN2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-2Q3LHN2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-2Q3LHN2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-2Q3LHN2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-2Q3LHN2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-2Q3LHN2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-2Q3LHN2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-2Q3LHN2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-2Q3LHN2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-2Q3LHN2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-2Q3LHN2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-2Q3LHN2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-2Q3LHN2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-2Q3LHN2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-2Q3LHN2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-2Q3LHN2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-2Q3LHN2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-2Q3LHN2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms