Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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PTPRNQ16849 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
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PTPRNQ16849 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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PTPRNQ16849 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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PTPRNQ16849 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRNQ16849 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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