Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 PTPRVP-203ENST00000638692 1189 ntTSL 1 (best)19.23■□□□□ 0.679e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LMBR1L-210ENST00000549296 560 ntTSL 519.21■□□□□ 0.679e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LMBR1L-205ENST00000547670 1866 ntTSL 1 (best)19.19■□□□□ 0.669e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 PIGQ-218ENST00000635909 2212 ntTSL 519.17■□□□□ 0.669e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 PPP1R13L-203ENST00000585905 2176 ntTSL 219.13■□□□□ 0.654e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CORO7-223ENST00000574311 1737 ntTSL 519.05■□□□□ 0.649e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SCRIB-205ENST00000526832 2189 ntTSL 1 (best)19■□□□□ 0.639e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 BAIAP2-225ENST00000576225 2316 ntTSL 219■□□□□ 0.639e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LMBR1L-225ENST00000552153 549 ntTSL 418.95■□□□□ 0.629e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CORO7-230ENST00000576437 1066 ntTSL 518.79■□□□□ 0.69e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 FAM189B-205ENST00000472550 948 ntTSL 518.79■□□□□ 0.64e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 BCAT2-205ENST00000595376 2254 ntTSL 218.67■□□□□ 0.584e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.574e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.569e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 HMG20B-215ENST00000585741 363 ntTSL 318.55■□□□□ 0.569e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.559e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CNOT3-209ENST00000617930 2047 ntTSL 218.44■□□□□ 0.541e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 ARHGAP4-222ENST00000494302 2667 ntTSL 518.44■□□□□ 0.549e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 NARF-203ENST00000374611 1722 ntTSL 518.4■□□□□ 0.549e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 AKAP8L-204ENST00000594893 1453 ntTSL 218.39■□□□□ 0.544e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 MAN2C1-202ENST00000421803 1111 ntTSL 218.37■□□□□ 0.539e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 MAN2C1-226ENST00000565784 571 ntTSL 418.37■□□□□ 0.539e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 MAN2C1-214ENST00000563539 659 ntTSL 418.37■□□□□ 0.539e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.534e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CORO7-209ENST00000571756 1890 ntTSL 218.31■□□□□ 0.529e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 FAM160B2-208ENST00000488968 2702 ntTSL 218.27■□□□□ 0.519e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.54e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.499e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 MIGA2-210ENST00000483458 2532 ntTSL 218.08■□□□□ 0.499e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.479e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 MYO1D-205ENST00000577576 581 ntTSL 317.99■□□□□ 0.479e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CCT7-208ENST00000471927 556 ntTSL 417.98■□□□□ 0.479e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CCT7-209ENST00000473197 595 ntTSL 417.98■□□□□ 0.479e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 FAM160B2-203ENST00000450006 2846 ntTSL 1 (best)17.97■□□□□ 0.479e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 COASY-209ENST00000588353 387 ntTSL 317.96■□□□□ 0.479e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.469e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 COASY-213ENST00000591753 2225 ntTSL 1 (best)17.85■□□□□ 0.459e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.449e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.449e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CCT7-206ENST00000464397 583 ntTSL 217.77■□□□□ 0.449e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 BAIAP2-210ENST00000572498 858 ntTSL 217.69■□□□□ 0.429e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.419e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 ARHGAP4-207ENST00000420383 2817 ntTSL 217.62■□□□□ 0.419e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SCRIB-208ENST00000546337 516 ntTSL 317.5■□□□□ 0.399e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.399e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 BCAT2-204ENST00000593515 1664 ntTSL 517.4■□□□□ 0.384e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 TOP3B-211ENST00000449704 543 ntTSL 317.36■□□□□ 0.374e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 PTPRVP-204ENST00000639439 821 ntTSL 1 (best)17.34■□□□□ 0.379e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.379e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.369e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.369e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.359e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 DDB2-212ENST00000617022 2181 ntTSL 217.19■□□□□ 0.349e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.344e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CNOT3-208ENST00000613073 2778 ntTSL 217.06■□□□□ 0.321e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 URGCP-213ENST00000497914 4360 ntTSL 1 (best)17.03■□□□□ 0.324e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 ARHGAP4-219ENST00000470209 2889 ntTSL 517■□□□□ 0.319e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.312e-10■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CNOT3-206ENST00000471126 541 ntTSL 316.93■□□□□ 0.31e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.299e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.299e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 NDUFA7-202ENST00000593729 569 ntTSL 216.81■□□□□ 0.289e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.289e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 NDUFA7-204ENST00000601101 414 ntTSL 416.79■□□□□ 0.289e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 TOP3B-204ENST00000430142 582 ntTSL 216.73■□□□□ 0.274e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CCT7-205ENST00000461290 1018 ntTSL 216.71■□□□□ 0.279e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.262e-10■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 MAN2C1-227ENST00000565801 712 ntTSL 216.66■□□□□ 0.269e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 HSF1-202ENST00000527328 2336 ntTSL 216.62■□□□□ 0.254e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LMBR1L-221ENST00000551535 874 ntTSL 216.4■□□□□ 0.229e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 ARHGAP4-205ENST00000404127 3232 ntTSL 516.23■□□□□ 0.199e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LMBR1L-202ENST00000417750 2334 ntTSL 216.2■□□□□ 0.189e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.182e-10■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 PPP6R1-204ENST00000587457 2389 ntTSL 216.15■□□□□ 0.184e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.184e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.169e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 HSF1-211ENST00000533130 493 ntTSL 316.02■□□□□ 0.164e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.159e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.154e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 MAN2C1-243ENST00000570257 992 ntTSL 515.89■□□□□ 0.139e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 DDB2-203ENST00000378601 1591 ntTSL 215.88■□□□□ 0.139e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.139e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 FDFT1-215ENST00000529464 932 ntTSL 1 (best)15.8■□□□□ 0.124e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CCT7-207ENST00000469844 612 ntTSL 415.8■□□□□ 0.129e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.114e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 NARF-220ENST00000582907 1454 ntTSL 515.75■□□□□ 0.119e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.14e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.19e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.061e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CORO7-221ENST00000573773 934 ntTSL 315.32■□□□□ 0.049e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 PRAME-209ENST00000439106 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.3■□□□□ 0.042e-10■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 PABPC4-208ENST00000461578 193 ntTSL 515.28■□□□□ 0.044e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.049e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 GLYR1-207ENST00000587936 897 ntTSL 515.17■□□□□ 0.029e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.029e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.014e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 HSF1-213ENST00000534314 684 ntTSL 215.03■□□□□ -04e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.019e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 FDFT1-219ENST00000531249 768 ntTSL 214.97□□□□□ -0.014e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.019e-6■■■□□ 18.2
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