Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3GAP1Q15042 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
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