Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAM2Q15035 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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