Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMCO1Q147U7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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