Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SNTB1Q13884 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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