Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOFQ13790 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOFQ13790 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOFQ13790 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOFQ13790 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOFQ13790 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOFQ13790 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOFQ13790 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOFQ13790 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOFQ13790 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOFQ13790 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOFQ13790 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOFQ13790 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOFQ13790 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOFQ13790 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOFQ13790 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOFQ13790 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOFQ13790 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOFQ13790 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOFQ13790 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOFQ13790 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOFQ13790 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOFQ13790 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOFQ13790 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOFQ13790 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOFQ13790 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOFQ13790 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOFQ13790 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOFQ13790 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOFQ13790 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOFQ13790 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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