Protein–RNA interactions for Protein: Q12324

YVC1, Calcium channel YVC1, yeastyeast

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YVC1Q12324 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt1.85□□□□□ -2.11
YVC1Q12324 snR14snR14 160 nt1.85□□□□□ -2.11
YVC1Q12324 YOR093CYOR093C 4947 nt1.85□□□□□ -2.11
YVC1Q12324 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt1.84□□□□□ -2.11
YVC1Q12324 IRC20YLR247C 4671 nt1.84□□□□□ -2.12
YVC1Q12324 PEP1YBL017C 4740 nt1.83□□□□□ -2.12
YVC1Q12324 NOP9YJL010C 2001 nt1.83□□□□□ -2.12
YVC1Q12324 SMC4YLR086W 4257 nt1.83□□□□□ -2.12
YVC1Q12324 snR190snR190 190 nt1.82□□□□□ -2.12
YVC1Q12324 IRA1YBR140C 9279 nt1.8□□□□□ -2.12
YVC1Q12324 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.79□□□□□ -2.12
YVC1Q12324 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt1.78□□□□□ -2.12
YVC1Q12324 VPS15YBR097W 4365 nt1.78□□□□□ -2.12
YVC1Q12324 STO1YMR125W 2586 nt1.78□□□□□ -2.12
YVC1Q12324 SPC110YDR356W 2835 nt1.77□□□□□ -2.13
YVC1Q12324 RPL26BYGR034W 384 nt1.77□□□□□ -2.13
YVC1Q12324 KAP122YGL016W 3246 nt1.76□□□□□ -2.13
YVC1Q12324 SKI3YPR189W 4299 nt1.76□□□□□ -2.13
YVC1Q12324 SET3YKR029C 2256 nt1.75□□□□□ -2.13
YVC1Q12324 WAR1YML076C 2835 nt1.75□□□□□ -2.13
YVC1Q12324 CHS1YNL192W 3396 nt1.75□□□□□ -2.13
YVC1Q12324 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt1.74□□□□□ -2.13
YVC1Q12324 GEA2YEL022W 4380 nt1.74□□□□□ -2.13
YVC1Q12324 YLR422WYLR422W 5799 nt1.74□□□□□ -2.13
YVC1Q12324 RAD9YDR217C 3930 nt1.73□□□□□ -2.13
YVC1Q12324 KCS1YDR017C 3153 nt1.72□□□□□ -2.13
YVC1Q12324 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt1.72□□□□□ -2.13
YVC1Q12324 SAC3YDR159W 3906 nt1.72□□□□□ -2.13
YVC1Q12324 RPS26AYGL189C 360 nt1.71□□□□□ -2.14
YVC1Q12324 ASE1YOR058C 2658 nt1.71□□□□□ -2.14
YVC1Q12324 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt1.7□□□□□ -2.14
YVC1Q12324 NUP192YJL039C 5052 nt1.7□□□□□ -2.14
YVC1Q12324 YCS4YLR272C 3531 nt1.7□□□□□ -2.14
YVC1Q12324 ROM2YLR371W 4071 nt1.69□□□□□ -2.14
YVC1Q12324 RPM2YML091C 3609 nt1.69□□□□□ -2.14
YVC1Q12324 MON2YNL297C 4911 nt1.69□□□□□ -2.14
YVC1Q12324 FYV8YGR196C 2454 nt1.67□□□□□ -2.14
YVC1Q12324 PET127YOR017W 2403 nt1.67□□□□□ -2.14
YVC1Q12324 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt1.67□□□□□ -2.14
YVC1Q12324 CFT1YDR301W 4074 nt1.67□□□□□ -2.14
YVC1Q12324 APL3YBL037W 3078 nt1.67□□□□□ -2.14
YVC1Q12324 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt1.66□□□□□ -2.14
YVC1Q12324 HKR1YDR420W 5409 nt1.66□□□□□ -2.14
YVC1Q12324 BEM3YPL115C 3387 nt1.65□□□□□ -2.15
YVC1Q12324 YDL073WYDL073W 2955 nt1.64□□□□□ -2.15
YVC1Q12324 SEC10YLR166C 2616 nt1.63□□□□□ -2.15
YVC1Q12324 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.63□□□□□ -2.15
YVC1Q12324 PRP16YKR086W 3216 nt1.62□□□□□ -2.15
YVC1Q12324 SWI4YER111C 3282 nt1.62□□□□□ -2.15
YVC1Q12324 AZF1YOR113W 2745 nt1.62□□□□□ -2.15
YVC1Q12324 PMD1YER132C 5262 nt1.62□□□□□ -2.15
YVC1Q12324 UBP3YER151C 2739 nt1.61□□□□□ -2.15
YVC1Q12324 CCH1YGR217W 6120 nt1.61□□□□□ -2.15
YVC1Q12324 SEC3YER008C 4011 nt1.61□□□□□ -2.15
YVC1Q12324 SEC8YPR055W 3198 nt1.61□□□□□ -2.15
YVC1Q12324 PIK1YNL267W 3201 nt1.59□□□□□ -2.16
YVC1Q12324 NNF2YGR089W 2811 nt1.59□□□□□ -2.16
YVC1Q12324 CDC25YLR310C 4770 nt1.58□□□□□ -2.16
YVC1Q12324 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.58□□□□□ -2.16
YVC1Q12324 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.58□□□□□ -2.16
YVC1Q12324 MSH3YCR092C 3057 nt1.58□□□□□ -2.16
YVC1Q12324 SSK2YNR031C 4740 nt1.57□□□□□ -2.16
YVC1Q12324 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt1.57□□□□□ -2.16
YVC1Q12324 snR47snR47 99 nt1.57□□□□□ -2.16
YVC1Q12324 NUP145YGL092W 3954 nt1.57□□□□□ -2.16
YVC1Q12324 TRM732YMR259C 4263 nt1.56□□□□□ -2.16
YVC1Q12324 CAT8YMR280C 4302 nt1.55□□□□□ -2.16
YVC1Q12324 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.55□□□□□ -2.16
YVC1Q12324 NUP188YML103C 4968 nt1.54□□□□□ -2.16
YVC1Q12324 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.53□□□□□ -2.16
YVC1Q12324 BRR2YER172C 6492 nt1.53□□□□□ -2.16
YVC1Q12324 YSP1YHR155W 3687 nt1.52□□□□□ -2.17
YVC1Q12324 BST1YFL025C 3090 nt1.52□□□□□ -2.17
YVC1Q12324 snR53snR53 91 nt1.51□□□□□ -2.17
YVC1Q12324 ORC3YLL004W 1851 nt1.51□□□□□ -2.17
YVC1Q12324 GLG1YKR058W 1851 nt1.5□□□□□ -2.17
YVC1Q12324 ANS1YHR126C 480 nt1.5□□□□□ -2.17
YVC1Q12324 SXM1YDR395W 2835 nt1.5□□□□□ -2.17
YVC1Q12324 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.49□□□□□ -2.17
YVC1Q12324 LAA1YJL207C 6045 nt1.49□□□□□ -2.17
YVC1Q12324 ULP2YIL031W 3105 nt1.48□□□□□ -2.17
YVC1Q12324 snR64snR64 101 nt1.45□□□□□ -2.18
YVC1Q12324 EST2YLR318W 2655 nt1.44□□□□□ -2.18
YVC1Q12324 MSN5YDR335W 3675 nt1.44□□□□□ -2.18
YVC1Q12324 EST1YLR233C 2100 nt1.43□□□□□ -2.18
YVC1Q12324 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt1.43□□□□□ -2.18
YVC1Q12324 CDC39YCR093W 6327 nt1.42□□□□□ -2.18
YVC1Q12324 snR69snR69 101 nt1.41□□□□□ -2.18
YVC1Q12324 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt1.39□□□□□ -2.19
YVC1Q12324 CSE1YGL238W 2883 nt1.39□□□□□ -2.19
YVC1Q12324 HUG1YML058W-A 207 nt1.36□□□□□ -2.19
YVC1Q12324 snR50snR50 90 nt1.35□□□□□ -2.19
YVC1Q12324 RDS3YPR094W 324 nt1.34□□□□□ -2.19
YVC1Q12324 CLU1YMR012W 3834 nt1.34□□□□□ -2.2
YVC1Q12324 YKL225WYKL225W 348 nt1.32□□□□□ -2.2
YVC1Q12324 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.32□□□□□ -2.2
YVC1Q12324 IML1YJR138W 4755 nt1.32□□□□□ -2.2
YVC1Q12324 VAM6YDL077C 3150 nt1.31□□□□□ -2.2
YVC1Q12324 NST1YNL091W 3723 nt1.29□□□□□ -2.2
YVC1Q12324 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt1.29□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 81 ms